Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB1P04280 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB1P04280 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB1P04280 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB1P04280 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB1P04280 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB1P04280 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB1P04280 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB1P04280 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB1P04280 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB1P04280 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB1P04280 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB1P04280 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB1P04280 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB1P04280 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB1P04280 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB1P04280 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB1P04280 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB1P04280 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB1P04280 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB1P04280 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB1P04280 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB1P04280 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB1P04280 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB1P04280 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB1P04280 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB1P04280 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB1P04280 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB1P04280 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB1P04280 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB1P04280 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB1P04280 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB1P04280 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PRB1P04280 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB1P04280 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB1P04280 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB1P04280 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB1P04280 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB1P04280 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB1P04280 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB1P04280 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB1P04280 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB1P04280 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB1P04280 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB1P04280 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB1P04280 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB1P04280 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB1P04280 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB1P04280 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB1P04280 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB1P04280 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB1P04280 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB1P04280 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms