Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4P02776 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4P02776 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4P02776 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4P02776 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4P02776 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4P02776 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4P02776 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4P02776 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4P02776 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4P02776 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4P02776 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4P02776 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4P02776 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4P02776 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4P02776 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4P02776 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4P02776 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4P02776 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4P02776 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PF4P02776 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PF4P02776 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PF4P02776 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PF4P02776 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PF4P02776 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PF4P02776 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PF4P02776 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PF4P02776 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PF4P02776 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PF4P02776 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PF4P02776 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PF4P02776 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PF4P02776 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PF4P02776 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PF4P02776 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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