Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC1P02654 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC1P02654 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC1P02654 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC1P02654 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC1P02654 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC1P02654 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC1P02654 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC1P02654 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC1P02654 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC1P02654 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC1P02654 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC1P02654 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms