Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTAP01374 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTAP01374 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTAP01374 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LTAP01374 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTAP01374 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTAP01374 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTAP01374 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTAP01374 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTAP01374 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTAP01374 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTAP01374 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTAP01374 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTAP01374 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTAP01374 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTAP01374 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTAP01374 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTAP01374 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTAP01374 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTAP01374 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTAP01374 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTAP01374 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTAP01374 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTAP01374 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTAP01374 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTAP01374 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTAP01374 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTAP01374 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms