Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL1O95922 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms