Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms