Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB11O95342 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB11O95342 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB11O95342 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB11O95342 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB11O95342 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB11O95342 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB11O95342 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB11O95342 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB11O95342 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB11O95342 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB11O95342 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms