Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms