Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR5O75473 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR5O75473 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR5O75473 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR5O75473 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR5O75473 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR5O75473 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR5O75473 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR5O75473 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR5O75473 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR5O75473 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR5O75473 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR5O75473 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR5O75473 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR5O75473 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR5O75473 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR5O75473 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGR5O75473 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGR5O75473 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGR5O75473 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGR5O75473 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LGR5O75473 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGR5O75473 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGR5O75473 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGR5O75473 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR5O75473 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LGR5O75473 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGR5O75473 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGR5O75473 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGR5O75473 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGR5O75473 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGR5O75473 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LGR5O75473 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGR5O75473 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGR5O75473 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGR5O75473 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGR5O75473 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGR5O75473 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGR5O75473 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGR5O75473 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGR5O75473 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms