Protein–RNA interactions for Protein: O75446

SAP30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30O75446 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAP30O75446 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SAP30O75446 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAP30O75446 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAP30O75446 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAP30O75446 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAP30O75446 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAP30O75446 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAP30O75446 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms