Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG13O75143 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG13O75143 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG13O75143 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG13O75143 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG13O75143 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG13O75143 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG13O75143 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG13O75143 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG13O75143 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG13O75143 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG13O75143 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG13O75143 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG13O75143 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG13O75143 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG13O75143 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG13O75143 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG13O75143 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG13O75143 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG13O75143 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG13O75143 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG13O75143 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG13O75143 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG13O75143 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG13O75143 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG13O75143 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG13O75143 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG13O75143 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG13O75143 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG13O75143 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG13O75143 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG13O75143 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG13O75143 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG13O75143 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG13O75143 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG13O75143 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG13O75143 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG13O75143 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG13O75143 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms