Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSNA1O43805 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms