Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTIFO43310 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTIFO43310 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTIFO43310 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTIFO43310 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTIFO43310 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTIFO43310 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTIFO43310 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTIFO43310 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTIFO43310 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTIFO43310 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTIFO43310 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTIFO43310 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTIFO43310 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTIFO43310 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTIFO43310 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTIFO43310 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTIFO43310 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTIFO43310 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTIFO43310 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTIFO43310 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTIFO43310 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTIFO43310 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTIFO43310 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTIFO43310 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTIFO43310 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTIFO43310 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTIFO43310 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTIFO43310 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTIFO43310 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTIFO43310 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTIFO43310 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTIFO43310 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTIFO43310 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTIFO43310 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTIFO43310 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTIFO43310 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTIFO43310 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTIFO43310 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTIFO43310 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTIFO43310 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTIFO43310 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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