Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APAF1O14727 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APAF1O14727 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APAF1O14727 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APAF1O14727 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APAF1O14727 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APAF1O14727 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APAF1O14727 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APAF1O14727 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APAF1O14727 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APAF1O14727 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APAF1O14727 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APAF1O14727 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APAF1O14727 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APAF1O14727 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APAF1O14727 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APAF1O14727 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
APAF1O14727 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
APAF1O14727 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APAF1O14727 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APAF1O14727 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APAF1O14727 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APAF1O14727 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APAF1O14727 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APAF1O14727 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
APAF1O14727 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APAF1O14727 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APAF1O14727 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APAF1O14727 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APAF1O14727 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APAF1O14727 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APAF1O14727 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APAF1O14727 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APAF1O14727 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APAF1O14727 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APAF1O14727 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APAF1O14727 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APAF1O14727 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APAF1O14727 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APAF1O14727 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APAF1O14727 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APAF1O14727 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APAF1O14727 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APAF1O14727 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APAF1O14727 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APAF1O14727 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APAF1O14727 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APAF1O14727 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APAF1O14727 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
APAF1O14727 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APAF1O14727 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APAF1O14727 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APAF1O14727 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APAF1O14727 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APAF1O14727 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APAF1O14727 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APAF1O14727 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
APAF1O14727 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
APAF1O14727 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APAF1O14727 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APAF1O14727 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APAF1O14727 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APAF1O14727 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APAF1O14727 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APAF1O14727 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APAF1O14727 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APAF1O14727 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APAF1O14727 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APAF1O14727 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APAF1O14727 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APAF1O14727 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APAF1O14727 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APAF1O14727 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APAF1O14727 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APAF1O14727 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APAF1O14727 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APAF1O14727 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APAF1O14727 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APAF1O14727 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APAF1O14727 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APAF1O14727 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms