Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS3O14543 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOCS3O14543 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms