Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGRNO00468 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGRNO00468 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGRNO00468 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGRNO00468 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGRNO00468 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGRNO00468 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGRNO00468 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
AGRNO00468 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
AGRNO00468 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
AGRNO00468 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
AGRNO00468 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGRNO00468 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGRNO00468 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGRNO00468 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
AGRNO00468 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGRNO00468 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGRNO00468 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGRNO00468 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGRNO00468 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGRNO00468 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGRNO00468 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGRNO00468 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGRNO00468 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGRNO00468 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGRNO00468 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGRNO00468 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AGRNO00468 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGRNO00468 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGRNO00468 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGRNO00468 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGRNO00468 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGRNO00468 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGRNO00468 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGRNO00468 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGRNO00468 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGRNO00468 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGRNO00468 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGRNO00468 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGRNO00468 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AGRNO00468 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGRNO00468 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGRNO00468 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms