Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
J3KT08 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms