Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCER2I3L3R5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms