Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PMD0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PMD0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PMD0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PMD0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PMD0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PMD0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PMD0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PMD0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PMD0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PMD0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PMD0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PMD0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PMD0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PMD0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PMD0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PMD0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PMD0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PMD0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PMD0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PMD0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PMD0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PMD0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PMD0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PMD0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PMD0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PMD0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PMD0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PMD0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PMD0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PMD0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PMD0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PMD0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PMD0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PMD0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PMD0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PMD0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PMD0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PMD0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PMD0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PMD0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PMD0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PMD0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PMD0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PMD0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PMD0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PMD0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PMD0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PMD0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PMD0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PMD0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PMD0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PMD0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PMD0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PMD0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PMD0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PMD0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PMD0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PMD0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PMD0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PMD0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PMD0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PMD0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PMD0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PMD0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PMD0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PMD0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PMD0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PMD0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PMD0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PMD0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PMD0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PMD0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PMD0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PMD0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PMD0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PMD0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PMD0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PMD0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PMD0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PMD0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PMD0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms