Protein–RNA interactions for Protein: B9A030

TISP43, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TISP43B9A030 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TISP43B9A030 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TISP43B9A030 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TISP43B9A030 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TISP43B9A030 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TISP43B9A030 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TISP43B9A030 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TISP43B9A030 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TISP43B9A030 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TISP43B9A030 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TISP43B9A030 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TISP43B9A030 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TISP43B9A030 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TISP43B9A030 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TISP43B9A030 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TISP43B9A030 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TISP43B9A030 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms