Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms