Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms