Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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