Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLTPD2A6NH11 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLTPD2A6NH11 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 895.8 ms