Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms