Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms