Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC182A6NF36 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC182A6NF36 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC182A6NF36 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC182A6NF36 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC182A6NF36 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC182A6NF36 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC182A6NF36 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC182A6NF36 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC182A6NF36 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC182A6NF36 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC182A6NF36 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms