Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM247A6NEH6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM247A6NEH6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms