Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SSC5DA1L4H1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSC5DA1L4H1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms