Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
A0A0U1RRA0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
A0A0U1RRA0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
A0A0U1RRA0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
A0A0U1RRA0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
A0A0U1RRA0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms