Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms