Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMM50Q9Y512 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMM50Q9Y512 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMM50Q9Y512 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMM50Q9Y512 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms