Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms