Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHDC2Q9Y2U9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms