Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YBX2Q9Y2T7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms