Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF5Q9Y2D1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms