Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms