Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNQ9UQP3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms