Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms