Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms