Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms