Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPDR1Q9UM22 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms