Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms