Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms