Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
KDM5BQ9UGL1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms