Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms