Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms