Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms