Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms