Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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